16号线西苑站位于圆明园西路和颐和园路交叉路口北侧，万泉河高架桥的南侧。车站周边有圆明园、颐和园等景点，西苑中医院等医疗机构，国际关系学院等学校以及多个住宅区，交通较为繁忙。
16号线西苑站主体为地下三层结构，站厅位于地下一层，是宽敞开阔的通厅；站台层位于地下三层，是常见的站台在中间、轨行区在两边的岛式站台。
在16号线西苑站南侧约120米处，是已经开通运营的京港地铁4号线西苑站。16号线与4号线在西苑站牵手，两线通过两条约6米宽、120米长的Y字形通道在站厅层实现换乘，宽敞且在同层的换乘通道将为乘客节省时间，方便乘客快捷换乘。
京港地铁预计，2017年16号线西苑站日均客流约为5.6万人次，其中换乘客流约为4.3万人次。